医療費を支払った日の翌日から起算して5年以内であれば払い戻しの申請ができます。
申請の手続きについては

「子育て支援医療費の資格がありますが、病院の窓口で医療費を支払いました。医療費の払い戻しの方法を知りたいのですが？」

をご覧ください。

【関連情報／リンク】
子育て支援医療費助成制度について
電子申請・届出サービス

※上記「電子申請・届出サービス」にアクセス後に表示される画面の左上「キーワードで探す」欄に、
　以下のキーワードを入力してください。

　（1）支給申請にかかる手続き（医療費払い戻し）
　　キーワード「子育て支援医療費助成金支給申請」

※キーワード検索後、区ごとに手続きするページが異なりますので、ご注意ください。
　（例）浦和区にお住まいの方が支給申請をする場合
　　→「子育て支援医療費助成金支給申請　浦和」と、
　　　お住まいの区名を入れて検索していただくとスムーズです。

※手続きの内容によっては、電子申請を受け付けていないものがあります。
　詳しくは、各手続きページの説明欄等をご確認ください。